起業したい方を応援する企業もありますから、求人情報にそういった記述がありましたら積極的に伝えていただいて問題ありません。応募の際には、経験を積みたいという点だけではなく、その企業に対してどんな貢献をしたいのかという点までしっかりとアピールなさることをおすすめします。

ただ、多くの企業が「長く勤めてくれる人材」を探していますので、退職が前提となる採用に、二の足を踏むケースが多いと思われます。また「うちの会社を踏み台にするのか」と不快に思う採用担当者がいるかもしれません。そのため求人情報に「起業したい方を応援します」といった記述がなければ、起業に関しては伝えないほうが無難だと思います。参考になさってください。